La Facultad de Ciencias Teológicas constituye un componente organizativo el cual coordina y desarrolla actividades inherentes a las funciones académicas de docencia, investigación y extensión y se ocupa de los conocimientos con los estudios teológicos. La Escuela de Teología constituye su ente operativo que reune a los profesores y estudiantes. La Facultad depende del Vicerrectorado Académico.